MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM3

Total Repeats: 30136

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017958	CGG	2	6	31	36	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874237
2	NC_017958	CGG	2	6	226	231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874237
3	NC_017958	AAC	2	6	233	238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389874237
4	NC_017958	GGC	2	6	327	332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874237
5	NC_017958	CGG	2	6	333	338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874237
6	NC_017958	GCC	3	9	344	352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874237
7	NC_017958	TCC	2	6	375	380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389874237
8	NC_017958	TCG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874237
9	NC_017958	TGGT	2	8	490	497	0 %	50 %	50 %	0 %	389874237
10	NC_017958	CCCA	2	8	505	512	25 %	0 %	0 %	75 %	389874237
11	NC_017958	GCCGC	2	10	570	579	0 %	0 %	40 %	60 %	389874237
12	NC_017958	ACA	2	6	590	595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389874237
13	NC_017958	CGG	2	6	602	607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874237
14	NC_017958	CGG	2	6	634	639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874237
15	NC_017958	CGC	2	6	681	686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874237
16	NC_017958	CCGCG	2	10	699	708	0 %	0 %	40 %	60 %	389874237
17	NC_017958	GAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389874237
18	NC_017958	GCCGC	2	10	830	839	0 %	0 %	40 %	60 %	389874237
19	NC_017958	GGA	2	6	894	899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389874237
20	NC_017958	GATGCC	2	12	915	926	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389874237
21	NC_017958	CGTGC	2	10	1008	1017	0 %	20 %	40 %	40 %	389874237
22	NC_017958	GTG	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874237
23	NC_017958	CGCC	2	8	1092	1099	0 %	0 %	25 %	75 %	389874237
24	NC_017958	GCA	2	6	1140	1145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874237
25	NC_017958	GC	3	6	1190	1195	0 %	0 %	50 %	50 %	389874237
26	NC_017958	GCA	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874237
27	NC_017958	TGC	2	6	1241	1246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874237
28	NC_017958	GCC	2	6	1285	1290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874237
29	NC_017958	TGG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874237
30	NC_017958	GC	3	6	1356	1361	0 %	0 %	50 %	50 %	389874237
31	NC_017958	GCA	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874237
32	NC_017958	CCG	2	6	1447	1452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874237
33	NC_017958	ACG	2	6	1472	1477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874237
34	NC_017958	GCA	2	6	1525	1530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874238
35	NC_017958	GCCA	2	8	1550	1557	25 %	0 %	25 %	50 %	389874238
36	NC_017958	CTG	2	6	1568	1573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874238
37	NC_017958	CTG	2	6	1622	1627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874238
38	NC_017958	CCG	2	6	1638	1643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874238
39	NC_017958	CCA	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874238
40	NC_017958	CGT	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874238
41	NC_017958	CTT	2	6	1888	1893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389874238
42	NC_017958	CCA	2	6	1896	1901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874238
43	NC_017958	GGC	2	6	2027	2032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874238
44	NC_017958	GC	3	6	2031	2036	0 %	0 %	50 %	50 %	389874238
45	NC_017958	CAC	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874238
46	NC_017958	ACC	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874238
47	NC_017958	GCT	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874238
48	NC_017958	CACC	2	8	2164	2171	25 %	0 %	0 %	75 %	389874238
49	NC_017958	GGC	2	6	2205	2210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874238
50	NC_017958	CCG	2	6	2223	2228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874238
51	NC_017958	CAA	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389874238
52	NC_017958	AGG	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389874238
53	NC_017958	CCA	2	6	2265	2270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874238
54	NC_017958	ACC	2	6	2276	2281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874238
55	NC_017958	GGGT	2	8	2308	2315	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017958	GC	3	6	2351	2356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017958	GC	3	6	2396	2401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017958	GCA	2	6	2435	2440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017958	CGA	2	6	2529	2534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874239
60	NC_017958	CGG	2	6	2682	2687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874239
61	NC_017958	CGG	2	6	2727	2732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874239
62	NC_017958	GTC	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874239
63	NC_017958	GCC	2	6	2757	2762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874239
64	NC_017958	CGC	2	6	2934	2939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874239
65	NC_017958	TCG	2	6	3083	3088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874239
66	NC_017958	CCCA	2	8	3098	3105	25 %	0 %	0 %	75 %	389874239
67	NC_017958	CGG	2	6	3155	3160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874239
68	NC_017958	CCT	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389874239
69	NC_017958	GCC	2	6	3217	3222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874239
70	NC_017958	CAG	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874239
71	NC_017958	GCG	2	6	3311	3316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874239
72	NC_017958	CG	3	6	3370	3375	0 %	0 %	50 %	50 %	389874239
73	NC_017958	GC	3	6	3396	3401	0 %	0 %	50 %	50 %	389874239
74	NC_017958	CG	3	6	3477	3482	0 %	0 %	50 %	50 %	389874239
75	NC_017958	CGAG	2	8	3528	3535	25 %	0 %	50 %	25 %	389874239
76	NC_017958	CTG	2	6	3558	3563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874239
77	NC_017958	CTG	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017958	CTG	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017958	A	6	6	3790	3795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017958	GCG	2	6	3861	3866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017958	CGG	2	6	3916	3921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017958	CG	3	6	3928	3933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017958	GGA	2	6	3941	3946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017958	GCC	2	6	3960	3965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017958	GC	3	6	4083	4088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017958	CTG	2	6	4146	4151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017958	GAGC	2	8	4229	4236	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017958	CTG	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017958	A	7	7	4271	4277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017958	GCA	2	6	4319	4324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017958	GAA	2	6	4353	4358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389874240
92	NC_017958	CGG	2	6	4367	4372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874240
93	NC_017958	AAG	2	6	4396	4401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389874240
94	NC_017958	CTG	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874240
95	NC_017958	TCGG	2	8	4568	4575	0 %	25 %	50 %	25 %	389874240
96	NC_017958	GCA	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874240
97	NC_017958	CTGG	2	8	4698	4705	0 %	25 %	50 %	25 %	389874240
98	NC_017958	AGG	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389874240
99	NC_017958	GAA	2	6	4725	4730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389874240
100	NC_017958	GCGA	2	8	4733	4740	25 %	0 %	50 %	25 %	389874240
101	NC_017958	AACC	2	8	4834	4841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017958	CTG	2	6	5017	5022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017958	CATCGC	2	12	5092	5103	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017958	GGGC	2	8	5308	5315	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017958	TGA	2	6	5585	5590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017958	GGA	2	6	5594	5599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017958	CTG	2	6	5681	5686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017958	GCG	2	6	5707	5712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017958	GAA	2	6	5757	5762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017958	TCGC	2	8	5826	5833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017958	CTC	2	6	5867	5872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017958	CG	3	6	5873	5878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017958	GCAA	2	8	5886	5893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017958	TGG	2	6	5956	5961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017958	CGT	2	6	5962	5967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017958	AAG	2	6	5982	5987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017958	CGA	2	6	6097	6102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017958	CGCC	2	8	6171	6178	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_017958	GAA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017958	CGC	2	6	6294	6299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017958	TGC	2	6	6315	6320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017958	TGC	2	6	6448	6453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874241
123	NC_017958	CCG	2	6	6484	6489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874241
124	NC_017958	CAC	2	6	6512	6517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874241
125	NC_017958	CGA	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874241
126	NC_017958	CAT	2	6	6593	6598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389874241
127	NC_017958	CGA	2	6	6605	6610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874241
128	NC_017958	CTT	2	6	6613	6618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389874241
129	NC_017958	AGC	2	6	6651	6656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874241
130	NC_017958	GTTC	2	8	6724	6731	0 %	50 %	25 %	25 %	389874241
131	NC_017958	CTTG	2	8	6739	6746	0 %	50 %	25 %	25 %	389874241
132	NC_017958	AAG	2	6	6752	6757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389874241
133	NC_017958	CCG	2	6	6832	6837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874241
134	NC_017958	GA	3	6	6906	6911	50 %	0 %	50 %	0 %	389874241
135	NC_017958	CG	3	6	6935	6940	0 %	0 %	50 %	50 %	389874241
136	NC_017958	CGG	2	6	7071	7076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874241
137	NC_017958	GCC	2	6	7092	7097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874241
138	NC_017958	GCGGTC	2	12	7124	7135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	389874241
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155	NC_017958	GGC	2	6	7769	7774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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267	NC_017958	CAA	2	6	12644	12649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_017958	TCA	2	6	12723	12728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_017958	GAT	2	6	12729	12734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017958	GCCA	2	8	12768	12775	25 %	0 %	25 %	50 %	389874247
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392	NC_017958	GGCGT	2	10	18599	18608	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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394	NC_017958	GCAC	2	8	18661	18668	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
395	NC_017958	GCA	2	6	18683	18688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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398	NC_017958	GGCCG	2	10	18735	18744	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
399	NC_017958	CGG	2	6	18762	18767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_017958	CG	3	6	18788	18793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
401	NC_017958	AAGCG	2	10	18828	18837	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
402	NC_017958	GC	3	6	18894	18899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
403	NC_017958	TGT	2	6	18942	18947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389874251
404	NC_017958	TGG	2	6	19032	19037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874251
405	NC_017958	AGC	2	6	19152	19157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874251
406	NC_017958	GCT	2	6	19204	19209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874251
407	NC_017958	CTG	2	6	19228	19233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874251
408	NC_017958	GCG	2	6	19239	19244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874251
409	NC_017958	TCC	2	6	19262	19267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389874251
410	NC_017958	CTG	2	6	19282	19287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874251
411	NC_017958	GCA	2	6	19345	19350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874252
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413	NC_017958	CG	4	8	19385	19392	0 %	0 %	50 %	50 %	389874252
414	NC_017958	CCG	2	6	19428	19433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874252
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422	NC_017958	CG	3	6	19586	19591	0 %	0 %	50 %	50 %	389874252
423	NC_017958	GCG	2	6	19677	19682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874252
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431	NC_017958	GCA	2	6	19984	19989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874253
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433	NC_017958	CGA	2	6	20144	20149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874253
434	NC_017958	GCG	2	6	20175	20180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874253
435	NC_017958	GCA	2	6	20249	20254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874253
436	NC_017958	GCA	2	6	20263	20268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874253
437	NC_017958	CGGC	2	8	20312	20319	0 %	0 %	50 %	50 %	389874254
438	NC_017958	GCCG	2	8	20325	20332	0 %	0 %	50 %	50 %	389874254
439	NC_017958	CCA	2	6	20336	20341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874254
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441	NC_017958	TCG	2	6	20387	20392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874254
442	NC_017958	CTG	2	6	20479	20484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874254
443	NC_017958	TGA	2	6	20492	20497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389874254
444	NC_017958	TGC	2	6	20507	20512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874254
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447	NC_017958	CCG	2	6	20660	20665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874254
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450	NC_017958	TCG	2	6	20825	20830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874254
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452	NC_017958	GCT	2	6	20874	20879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874254
453	NC_017958	TCGG	2	8	20884	20891	0 %	25 %	50 %	25 %	389874254
454	NC_017958	GCGCC	2	10	20931	20940	0 %	0 %	40 %	60 %	389874254
455	NC_017958	CTG	2	6	20941	20946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874254
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459	NC_017958	CAT	2	6	21054	21059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389874254
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461	NC_017958	TTC	2	6	21112	21117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389874254
462	NC_017958	GGCCT	2	10	21124	21133	0 %	20 %	40 %	40 %	389874254
463	NC_017958	GGCG	2	8	21150	21157	0 %	0 %	75 %	25 %	389874254
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466	NC_017958	GCC	3	9	21223	21231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874254
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469	NC_017958	GC	3	6	21557	21562	0 %	0 %	50 %	50 %	389874255
470	NC_017958	TGC	2	6	21565	21570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874255
471	NC_017958	TCA	2	6	21664	21669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389874255
472	NC_017958	GTG	2	6	21681	21686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874255
473	NC_017958	GCCGCA	2	12	21740	21751	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389874255
474	NC_017958	GCGCG	2	10	21752	21761	0 %	0 %	60 %	40 %	389874255
475	NC_017958	GTG	2	6	21786	21791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874255
476	NC_017958	GGCA	2	8	21832	21839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
477	NC_017958	TAT	2	6	21857	21862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_017958	CAC	2	6	21920	21925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874256
479	NC_017958	CTG	2	6	21929	21934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874256
480	NC_017958	TGC	2	6	21957	21962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874256
481	NC_017958	GAT	2	6	21997	22002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389874256
482	NC_017958	CGA	2	6	22003	22008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874256
483	NC_017958	CAC	2	6	22016	22021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874256
484	NC_017958	TGC	2	6	22056	22061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874256
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489	NC_017958	CCT	2	6	22307	22312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389874257
490	NC_017958	CGG	2	6	22314	22319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874257
491	NC_017958	TCG	2	6	22355	22360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874257
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495	NC_017958	GGCT	2	8	22474	22481	0 %	25 %	50 %	25 %	389874257
496	NC_017958	GCT	2	6	22485	22490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874257
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